Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms