Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D9D9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D9D9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms