Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn9Q9D805 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms