Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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