Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa5Q9D7I0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms