Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfn4Q9D6I3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfn4Q9D6I3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms