Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubb4aQ9D6F9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms