Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabra4Q9D6F4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra4Q9D6F4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms