Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms