Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ribc2Q9D4Q1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ribc2Q9D4Q1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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