Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf6Q9D4J7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf6Q9D4J7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms