Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sgms2Q9D4B1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sgms2Q9D4B1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgms2Q9D4B1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sgms2Q9D4B1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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