Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1Q9D495 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms