Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms