Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4933428M09RikQ9D3X3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms