Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rufy3Q9D394 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms