Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt20Q9D312 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt20Q9D312 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms