Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms