Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms