Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nol3Q9D1X0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms