Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms