Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mms19Q9D071 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Mms19Q9D071 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Mms19Q9D071 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Mms19Q9D071 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Mms19Q9D071 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Mms19Q9D071 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mms19Q9D071 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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