Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmss1Q9CZT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmss1Q9CZT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmss1Q9CZT6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmss1Q9CZT6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cmss1Q9CZT6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cmss1Q9CZT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmss1Q9CZT6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms