Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl35Q9CZ49 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl35Q9CZ49 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl35Q9CZ49 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl35Q9CZ49 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl35Q9CZ49 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl35Q9CZ49 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl35Q9CZ49 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms