Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms