Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms