Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl11Q9CXW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms