Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smurf1Q9CUN6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smurf1Q9CUN6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms