Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930524J08RikQ9CUJ5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms