Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ska2Q9CR46 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms