Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms