Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQF4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQF4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms