Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms