Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CQ90 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms