Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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