Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim3Q99PE5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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