Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NsmfQ99NF2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NsmfQ99NF2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms