Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atoh8Q99NA2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atoh8Q99NA2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms