Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim11aQ99J19 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms