Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cldn16Q925N4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Cldn16Q925N4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn16Q925N4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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