Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim59Q922Y2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim59Q922Y2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms