Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf3Q922U1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf3Q922U1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms