Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Odf3Q920N1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Odf3Q920N1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Odf3Q920N1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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