Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cts3Q91ZD5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cts3Q91ZD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms