Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna2Q91X60 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms