Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx15Q91WE1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms