Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NifkQ91VE6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NifkQ91VE6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms