Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ApofQ91V80 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApofQ91V80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms