Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps4aQ8VEJ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps4aQ8VEJ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms