Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul7Q8VE73 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul7Q8VE73 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms